3D Data Analysis

3D Image Analysis

Signal detection and segmentation

• High-accuracy target detection using proprietary algorithms developed for 3D image analysis
• Detection of point-like signals such as cell nuclei based on their three-dimensional shapes
• Segmentation of linear structures such as blood vessels and nerve fibers using 3D morphology and machine-learning models
• Signal extraction by comparison with averaged control images

Quantitative analysis

Statistical analysis and visualization

• Quantification of total signal volume (count), total signal intensity, mean signal volume (count), and mean signal intensity for each atlas region
• Generation of 3D images with signals mapped onto the atlas
• Generation of 2D-like cross-sectional images from arbitrary directions
• Calculation of p-values for each region and 3D visualization

3D画像解析

シグナル検出・セグメンテーション

• 3D画像解析用に開発された独自アルゴリズムを用いて高精度に標的を検出
• 細胞核などの点状シグナルを3次元的な形状から検出
• 血管・神経線維などの線状シグナルを、3次元形状と機械学習モデルを用いてセグメンテーション
• コントロールサンプルなどの平均画像との差分によるシグナル抽出

定量解析

統計解析・可視化

• アトラス各領域ごとの総シグナル volume（count）、総シグナル強度、平均シグナル volume（count）、平均シグナル強度を定量可能
• 上記シグナルをアトラス上にマッピングした3D画像の作成
• 任意方向からの2D風断面画像の作成
• 領域ごとの p-value 計算および3D可視化

Figure. Representative movie and heatmap for each sample.

Figure. Spatial p-value map comparing sample groups.

三维图像分析

信号检测与分割

• 使用为三维图像分析开发的专有算法进行高精度目标检测
• 基于三维形态检测细胞核等点状信号
• 利用三维形态与机器学习模型对血管、神经纤维等线状结构进行分割
• 通过与对照样本平均图像的差分提取信号

定量分析

统计分析与可视化

• 可定量每个图谱区域的总信号体积（计数）、总信号强度、平均信号体积（计数）及平均信号强度
• 生成将信号映射到图谱上的三维图像
• 从任意方向生成二维截面图像
• 各区域 p 值计算及三维可视化

3D 영상 분석

신호 검출 및 분할

• 3D 영상 분석을 위해 개발된 독자 알고리즘을 이용한 고정밀 타깃 검출
• 세포핵과 같은 점 형태 신호를 3차원 형상 기반으로 검출
• 혈관·신경섬유와 같은 선형 구조를 3차원 형상과 머신러닝 모델로 분할
• 대조군 평균 영상과의 차이를 이용한 신호 추출

정량 분석

통계 분석 및 시각화

• 아틀라스 각 영역별 총 신호 부피(카운트), 총 신호 강도, 평균 신호 부피(카운트), 평균 신호 강도 정량화
• 신호를 아틀라스에 매핑한 3D 영상 생성
• 임의 방향의 2D 단면 영상 생성
• 영역별 p‑value 계산 및 3D 시각화

Analyse d’images 3D

Détection et segmentation des signaux

• Détection de cibles de haute précision à l’aide d’algorithmes propriétaires développés pour l’analyse d’images 3D
• Détection de signaux ponctuels tels que les noyaux cellulaires à partir de leur forme tridimensionnelle
• Segmentation de structures linéaires telles que les vaisseaux et les fibres nerveuses à l’aide de modèles 3D et d’apprentissage automatique
• Extraction de signaux par différence avec des images moyennes de contrôle

Analyse quantitative

Analyse statistique et visualisation

• Quantification du volume total de signal (comptage), de l’intensité totale, du volume moyen (comptage) et de l’intensité moyenne pour chaque région de l’atlas
• Génération d’images 3D avec les signaux mappés sur l’atlas
• Génération de coupes de type 2D dans des directions arbitraires
• Calcul des valeurs p par région et visualisation 3D

3D‑Bildanalyse

Signaldetektion und Segmentierung

• Hochpräzise Zielerkennung mit proprietären, für die 3D‑Bildanalyse entwickelten Algorithmen
• Detektion punktförmiger Signale wie Zellkerne auf Basis ihrer dreidimensionalen Form
• Segmentierung linearer Strukturen wie Blutgefäße und Nervenfasern mithilfe von 3D‑Formmerkmalen und Machine‑Learning‑Modellen
• Signalextraktion durch Vergleich mit gemittelten Kontrollbildern

Quantitative Analyse

Statistische Analyse und Visualisierung

• Quantifizierung von Gesamt‑Signalvolumen (Count), Gesamtintensität, mittlerem Signalvolumen (Count) und mittlerer Signalintensität je Atlasregion
• Erstellung von 3D‑Bildern mit auf den Atlas projizierten Signalen
• Erstellung von 2D‑ähnlichen Schnitten aus beliebigen Richtungen
• Berechnung von p‑Werten je Region und 3D‑Visualisierung

Análisis de imágenes 3D

Detección y segmentación de señales

• Detección de objetivos de alta precisión mediante algoritmos propietarios desarrollados para el análisis de imágenes 3D
• Detección de señales puntuales como núcleos celulares a partir de su forma tridimensional
• Segmentación de estructuras lineales como vasos sanguíneos y fibras nerviosas mediante modelos 3D y de aprendizaje automático
• Extracción de señales mediante la diferencia con imágenes promedio de control

Análisis cuantitativo

Análisis estadístico y visualización

• Cuantificación del volumen total de señal (conteo), intensidad total, volumen medio (conteo) e intensidad media por región del atlas
• Generación de imágenes 3D con las señales mapeadas en el atlas
• Generación de secciones tipo 2D desde direcciones arbitrarias
• Cálculo de valores p por región y visualización 3D

Анализ 3D‑изображений

Обнаружение и сегментация сигналов

• Высокоточное обнаружение целей с использованием собственных алгоритмов для анализа 3D‑изображений
• Обнаружение точечных сигналов, таких как клеточные ядра, на основе их трёхмерной формы
• Сегментация линейных структур, таких как кровеносные сосуды и нервные волокна, с использованием 3D‑признаков и моделей машинного обучения
• Выделение сигналов путём сравнения со средними контрольными изображениями

Количественный анализ

Статистический анализ и визуализация

• Количественная оценка общего объёма сигнала (подсчёт), общей интенсивности, среднего объёма (подсчёт) и средней интенсивности для каждой области атласа
• Создание 3D‑изображений с нанесением сигналов на атлас
• Создание 2D‑срезов из произвольных направлений
• Расчёт p‑значений по областям и 3D‑визуализация